一、慶功宴后的野心火苗
論文見(jiàn)刊那天，302實(shí)驗室罕見(jiàn)地提前下了班。林卷卷抱著(zhù)剛打印出來(lái)的論文單行本，非要拉著(zhù)江硯去學(xué)校門(mén)口的麻辣燙店“慶功”。
“江博士，你看這紅湯多像我們飆升的影響因子！”林卷卷舉著(zhù)筷子，把一串魚(yú)丸浸在滾燙的紅油里，“二區頂刊只是開(kāi)胃菜，下次我們直接上CNS豪華套餐！”
江硯看著(zhù)她被辣得通紅的鼻尖，默默遞過(guò)一杯冰可樂(lè )：“先吃你的魚(yú)丸?！彼焐喜懖惑@，指尖卻在桌下摩挲著(zhù)手機——屏幕上是Nature最新一期的目錄，其中一篇關(guān)于單細胞空間轉錄組的論文，被他標了三個(gè)醒目的紅圈。
“說(shuō)真的，”林卷卷吸溜著(zhù)面條，突然正經(jīng)起來(lái)，“Dragon-Seq 2.0雖然牛，但總覺(jué)得還差口氣。就像打游戲通關(guān)了普通難度，不試試地獄模式怎么甘心？”
江硯抬眼，眼底閃過(guò)一絲笑意：“如果我說(shuō)，有個(gè)方向可能打敗現有單細胞分析的范式，難度系數堪比同時(shí)解十道NP難題，你敢不敢接？”
“接！”林卷卷想都沒(méi)想就拍了桌子，麻辣燙的湯汁濺到白大褂上也毫不在意，“只要能發(fā)Nature，別說(shuō)NP難題，讓我給測序儀唱《征服》都行！”
那天晚上，兩人踩著(zhù)月光走回實(shí)驗室。林卷卷拿著(zhù)根樹(shù)枝當劍，邊比劃邊喊：“Nature副本，我林卷卷來(lái)啦！小怪們接招！”江硯跟在她身后，聽(tīng)著(zhù)她把頂級期刊比作游戲副本，突然覺(jué)得那座遙不可及的學(xué)術(shù)高峰，似乎也沒(méi)那么陡峭了。
二、實(shí)驗室黑板上的狂想曲
第二天一早，林卷卷剛沖進(jìn)實(shí)驗室，就被黑板上的內容驚得差點(diǎn)咬掉舌頭。
原本干凈的黑板上，被江硯用白色粉筆寫(xiě)滿(mǎn)了公式和示意圖：從單細胞測序數據的時(shí)間序列建模，到空間位置信息的整合算法，再到與蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò )的動(dòng)態(tài)關(guān)聯(lián)……最后用紅色粉筆圈出三個(gè)大字：時(shí)空圖譜。
“這、這是……”林卷卷指著(zhù)黑板，結結巴巴地說(shuō)不出話(huà)。
“單細胞時(shí)空動(dòng)態(tài)圖譜?！苯幉亮瞬潦稚系姆酃P灰，語(yǔ)氣平靜得像在說(shuō)今天的天氣，“現有技術(shù)能測單細胞的基因表達，能看空間位置，卻沒(méi)法把時(shí)間維度加進(jìn)去——細胞是怎么從胚胎干細胞分化成神經(jīng)細胞的？腫瘤細胞在體內遷移時(shí)基因表達如何變化？這些動(dòng)態(tài)過(guò)程，我們現在只能靠推測?！?/p>
他拿起粉筆，在“時(shí)空圖譜”旁邊畫(huà)了個(gè)簡(jiǎn)單的坐標軸：“橫軸是空間位置，縱軸是基因表達，第三軸是時(shí)間。我們要做的，就是用算法給細胞‘拍電影’，讓它的每一個(gè)變化都無(wú)所遁形?！?/p>
林卷卷的眼睛越睜越大，手里的早餐面包“啪嗒”掉在地上：“這、這要是做出來(lái)，豈不是能直接看到細胞的‘前世今生’？”
“不止?！苯幍闹讣恻c(diǎn)在黑板上的一個(gè)節點(diǎn)，“如果能實(shí)現，癌癥轉移機制、胚胎發(fā)育奧秘、甚至神經(jīng)退行性疾病的病程進(jìn)展，都可能被重新定義?！?/p>
林卷卷突然撲到黑板前，拿起紅色粉筆在“時(shí)空圖譜”下方畫(huà)了個(gè)大大的游戲手柄，旁邊寫(xiě)著(zhù)：SCI大富翁之Nature副本開(kāi)荒計劃——主線(xiàn)任務(wù)：解鎖細胞時(shí)空密碼。
“江博士，”她轉過(guò)身，眼睛亮得像藏了整片星空，“這副本，我跟你刷了！”
江硯看著(zhù)黑板上嚴肅的科學(xué)構想和幼稚的游戲涂鴉奇妙共存，嘴角的弧度再也藏不住。他拿起黑板擦，卻沒(méi)有擦掉那個(gè)游戲手柄，只是輕聲說(shuō)：“先說(shuō)好，這個(gè)副本的BOSS比你想象的難打?！?/p>
三、第一關(guān)：數據海嘯與代碼防線(xiàn)
開(kāi)荒計劃啟動(dòng)的第一周，林卷卷就體會(huì )到了“Nature副本”的下馬威——數據量。
為了構建時(shí)空圖譜，他們需要整合三種數據：?jiǎn)渭毎麥y序的基因表達矩陣（動(dòng)輒幾十GB）、空間轉錄組的位置信息（三維坐標點(diǎn)云數據）、以及顯微鏡拍攝的時(shí)間序列影像（每小時(shí)產(chǎn)生200GB原始數據）。
“這哪是數據啊，這是海嘯！”林卷卷盯著(zhù)服務(wù)器的存儲容量報警界面，哀嚎著(zhù)癱在椅子上，“我們現有的算力，處理這些數據就像用算盤(pán)解微積分！”
江硯正在調試新到的超算節點(diǎn)，聞言回頭：“我申請了學(xué)校的GPU集群資源，但調度優(yōu)先級不夠。需要優(yōu)化算法，把數據壓縮到現有算力能啃得動(dòng)的程度?！?/p>
“壓縮？”林卷卷突然坐直，眼睛一轉，“有了！我可以用Transformer模型做特征提取，就像給數據‘脫水’！保留精華，丟掉雜質(zhì)！”
她撲到電腦前，手指在鍵盤(pán)上翻飛，屏幕上跳出一行行代碼：“你看，把基因表達矩陣當成‘文本’，空間位置當‘上下文’，時(shí)間序列當‘語(yǔ)序’……說(shuō)不定能訓練出個(gè)‘細胞語(yǔ)言翻譯器’！”
江硯湊過(guò)去看，發(fā)現她竟把自然語(yǔ)言處理的思路嫁接到了生物數據上。那些原本雜亂無(wú)章的數據，在她的算法里被賦予了“語(yǔ)義”，冗余信息被精準剔除，數據量瞬間壓縮到原來(lái)的1/5。
“邏輯……居然能自洽?！苯庪y得沒(méi)吐槽，指尖輕輕點(diǎn)在屏幕上的一個(gè)函數，“這里加個(gè)注意力掩碼，讓模型更關(guān)注時(shí)間維度的變化?！?/p>
林卷卷立刻照做，代碼運行的進(jìn)度條飛速推進(jìn)。當最終的壓縮率顯示為19.7%時(shí)，兩人對視一眼，都從對方眼里看到了興奮。
“第一關(guān)，通關(guān)！”林卷卷比了個(gè)勝利手勢，突然想起什么，“對了，這模型叫什么名字好？‘細胞壓縮餅干’？還是‘時(shí)空脫水機’？”
江硯：“……叫‘Temporal-Seq’?！?/p>
四、閻王爺的冷嘲與內部的熱望
他們要沖擊Nature的消息，不知怎么傳到了閻正明耳朵里。某天組會(huì )結束，閻正明特意路過(guò)302實(shí)驗室，陰陽(yáng)怪氣地敲了敲門(mén)框。
“小江啊，有志向是好的，但也別好高騖遠?！彼沉搜酆诎迳系摹皶r(shí)空圖譜”，嘴角撇出一絲嘲諷，“Nature可不是二區期刊，不是靠點(diǎn)小聰明就能混進(jìn)去的?！?/p>
趙宇跟在后面，假惺惺地附和：“就是啊江師弟，聽(tīng)說(shuō)你們連超算資源都申請不到？要不我跟閻老師說(shuō)說(shuō)，把我們組淘汰的舊服務(wù)器借給你們？”
林卷卷正調試著(zhù)算法，聞言直接懟回去：“舊服務(wù)器就留給趙師兄當游戲機吧，我們的代碼怕它跑起來(lái)自燃?！?/p>
江硯按住想沖上去理論的林卷卷，對閻正明說(shuō)：“多謝導師關(guān)心，我們會(huì )按計劃推進(jìn)?！?/p>
閻正明見(jiàn)沒(méi)討到便宜，悻悻地走了。林卷卷氣得直跺腳：“他分明就是怕我們超過(guò)他！”
“所以才要更努力?！苯幋蜷_(kāi)數據文件夾，“你看，張院士把他珍藏的小鼠胚胎發(fā)育數據集借給我們了?！?/p>
林卷卷湊過(guò)去，看到文件夾里的實(shí)驗記錄密密麻麻，標注著(zhù)“2010-2023”：“張院士也太給力了吧！”
“他說(shuō)，”江硯頓了頓，語(yǔ)氣里帶著(zhù)不易察覺(jué)的鄭重，“龍騰大學(xué)該有篇能讓世界記住的Nature了?！?/p>
那天下午，計算機系的教授聽(tīng)說(shuō)了他們的計劃，主動(dòng)派來(lái)兩個(gè)博士生幫忙優(yōu)化代碼；生科院的技術(shù)員偷偷塞給林卷卷一把細胞房的備用鑰匙：“凌晨三點(diǎn)的顯微鏡沒(méi)人搶?zhuān)銈儽M管用?！?/p>
實(shí)驗室的黑板上，除了“時(shí)空圖譜”，漸漸多了些歪歪扭扭的留言：
“加油！等你們上Nature封面！”（來(lái)自隔壁實(shí)驗室的師妹）
“代碼有bug可以找我，免費！”（計算機系學(xué)霸）
“這是我珍藏的咖啡因片，熬夜必備！”（某不知名的熱心同學(xué)）
林卷卷看著(zhù)那些暖心的字跡，突然覺(jué)得，這場(chǎng)Nature副本的開(kāi)荒，他們不是孤軍奮戰。
五、深夜的泡面與星空
為了趕在國際單細胞大會(huì )前拿出初步成果，兩人幾乎住在了實(shí)驗室。凌晨三點(diǎn)的302，永遠亮著(zhù)兩盞燈：江硯那邊是顯微鏡的冷光，林卷卷這邊是電腦屏幕的藍光。
某個(gè)深夜，林卷卷的代碼突然跑出一組奇怪的結果——小鼠胚胎干細胞在分化過(guò)程中，某個(gè)基因的表達模式呈現出周期性波動(dòng)，像一串神秘的密碼。
“江博士！你快看這個(gè)！”她舉著(zhù)電腦沖到細胞房，江硯正在給樣本染色，聞言立刻放下移液槍。
屏幕上的折線(xiàn)圖像跳動(dòng)的心臟，在時(shí)間軸上畫(huà)出優(yōu)美的正弦曲線(xiàn)。江硯的呼吸瞬間屏?。骸斑@是……生物鐘基因？在單細胞水平上居然能觀(guān)測到這么規律的波動(dòng)？”
“不止呢！”林卷卷調出空間分布圖，“你看它的表達位置，隨著(zhù)時(shí)間推移在細胞內移動(dòng)，像在跳某種舞蹈！”
兩人對著(zhù)那組數據研究了整整三個(gè)小時(shí)，直到窗外泛起魚(yú)肚白才意識到餓。林卷卷從抽屜里翻出最后兩桶泡面，用燒杯煮了開(kāi)水。
“江博士，你說(shuō)我們能成功嗎？”她吸著(zhù)泡面，突然有點(diǎn)忐忑，“Nature那么難，萬(wàn)一……”
“沒(méi)有萬(wàn)一?！苯幋驍嗨?，把自己碗里的雞蛋夾給她，“你的代碼能跑，我的實(shí)驗數據可靠，剩下的交給科學(xué)本身?！?/p>
林卷卷看著(zhù)他認真的側臉，突然笑了：“對！代碼能跑就是勝利！就算這次不行，我們再改再試，總有一天能把‘時(shí)空圖譜’敲進(jìn)Nature的接收列表！”
那天清晨，他們并肩站在實(shí)驗室的窗邊，看著(zhù)第一縷陽(yáng)光照在“時(shí)空圖譜”的黑板上。林卷卷掏出手機，拍下這一幕，設成了屏保。
“Nature副本開(kāi)荒日志，Day 15?！彼谂笥讶?xiě)下這句話(huà)，配了張泡面和黑板的合影，“BOSS很兇，但我們的裝備也在升級。沖！”
江硯刷到這條朋友圈時(shí)，正在調試顯微鏡。他猶豫了幾秒，點(diǎn)了個(gè)贊，然后把自己的手機屏保，換成了那張林卷卷趴在桌上睡顏的照片。
Nature之路注定布滿(mǎn)荊棘，但此刻的302實(shí)驗室里，野心與信任正在悄悄發(fā)酵，像培養基里悄然生長(cháng)的細胞，終將綻放出驚人的力量。